Анастасия Мельничук приняла участие в VIII школе по почвенной зоологии и экологии ТюмГУ

Научная сотрудница лаборатории молекулярной биологии и биотехнологии ВНИИВЭА – филиала ТюмНЦ СО РАН Анастасия Мельничук приняла участие в VIII Школе по почвенной зоологии и экологии для молодых ученых. Это мероприятие, проходившее с 4 по 8 сентября 2023 года в Институте экологической и сельскохозяйственной биологии (X-BIO) Тюменского государственного университета, было посвящено ДНК-метабаркодированию почвенных сообществ, от простейших до жуков.

В рамках школы участникам предоставилась возможность временно переехать на озеро Кучак, где они занимались сбором материала в окрестностях, их сортировкой и определением типов собранного материала. Кроме того, школа предлагала множество интересных лекций ведущих специалистов в области, включая приглашенных лекторов из Японии. Лекции затрагивали такие темы, как методология метабаркодирования, основы получения баркодов, ДНК-секвенирование, построение филогений и определение видовых границ.

Анастасия также приняла участие в практических занятиях, которые включали выделение ДНК из почвы и насекомых, амплификацию ДНК и очистку продукта с использованием фореза. Однако наибольший интерес представляло изучение анализа ДНК последовательностей с использованием методов Maximum Likelihood и Bayesian Inference, а также овладение методами p-distance, ABGD, PTP и GMYC.

ДНК-метабаркодирование почвенных сообществ — это метод, который позволяет идентифицировать организмы в почве с использованием фрагментов их генетического материала. Этот метод позволяет нам получить информацию о структуре и функционировании почвенных экосистем. Изучение различных групп организмов, начиная с простейших и заканчивая жуками, помогает лучше понять взаимодействие между ними и их влияние на окружающую среду.

Участие Анастасии в школе по почвенной зоологии и экологии для молодых ученых позволит ей применить новые методы для решения исследовательских задач лаборатории молекулярной биологии и биотехнологии ВНИИВЭА – филиала ТюмНЦ СО РАН.